GenomeBrowser written in Java. Ensembl DB를 Apollo로도 볼 수 있다. BDGP의 한가지

http://apollo.berkeleybop.org/

주요기능

• Genome data 의 viewing 및 navigation
• 사용자가 직접 annotation을 추가할 수 있다. exon merging/split등등

• 특정 영역별 서열데이터(.fasta) 및 MultipleAlignment 데이터(.msf)를 따로 저장할 수 있다.

지원하는 입력 포맷

• XML

  • GAME

  • Chado

• Ensembl

  • GFF file

  • Direct MySQL connection to Ensembl

• GenBank

• EMBL

• Analysis result

  • BLAST

  • Sim4

  • Blat

  • Fgenesh

  • GenScan

  • tRNAscan-SE

  • RepeatMasker

SeeAlso WebApollo

CategoryProgramBio