최근의 생물정보학방법들에 의해서 많은 데이터들이 전세계 인터넷을 통해서 제공되고 있다. 그러나, 이들 데이터들은 모두, 개개의 성격에 맞도록 특성화되어 있다. 

GenBank의 서열정보를 가지고, 바로 병세정보 및 ProteinStructure정보들을 바로 얻어낼 수 없는 상황이다. 생명현상은 이들 개개의 모든 정보들의 종합임을 되새겨보면, 이들 데이터들을 효과적으로 서로 통합시키고, 연결시키는 과정이 얼마자 중요한가를 알 수 있을 것이다. 따라서 이 분야, BioDatabaseIntegration 역시 생물정보학의 큰 도전으로 여겨지고 있다. 

=== Important BiologicalDatabase for Bioinformatics ===

 * [[Genome]]
  * [[Ensembl]], [[AceDb]]
  * [[GDB]], NcbiGenome, [[Ensembl]], FlyBase, [[MGD]], [[SGD]], [[MITOMAP]]
  * [[GOLD]]
  * RepetitiveSequence : RepBase
  * TranscriptionFactor : TransFac
  * [[PEDANT]]

 * NucleicAcid 
  * 기본정보 : [[Entrez]], GenBank, [[EMBL]], [[DDBJ]], NcbiGenome
  * [[EST]] : [[dbEST]], UniGene, TigrGeneIndices, StackDb, [[H-InvDB]]
  * [[Gene]] : GeneCards
  * [[Promoter]] : [[EPD]]
  * [[STS]] : [[dbSTS]], [[RHdb]]
  * Vector : UniVec
  * Polymorphic region : [[dbSNP]]
  * Somatic mutation in [[Cancer]]: [[COSMIC]]
  * [[GSEA]]: [[MSigDB]]

 * Variation
  * [[KMD]]

 * [[Protein]]
  * 기본정보 : SwissProt, InterPro, GenPept, TrEmbl, TrEst, TrGen, [[PIR]], UniProt
  * ProteinFamily : [[PROSITE]], [[Blocks]], [[Pfam]], ProDom, [[PRINTS]], [[COG]], [[CDD]]
  * ProteinStructure : [[PDB]], [[SCOP]], [[CATH]], [[FSSP]]
  * ProteinProteinInteraction : [[DIP]], [[MIPS]], [[http://portal.curagen.com/pathcalling_portal/index.htm|PathCalling]], ProNet

 * BiologicalPathway
  * [[KEGG]]
  * EcoCyc
  * MolecularInteraction : [[BIND]]
  * BioCarta
  * [[STKE]]

 * GeneticDisease
  * [[OMIM]]
  * [[HemoPDB]]

 * Biochemical 
  * [[REBASE]], [[LIGAND]], [[BRENDA]] 
  * DrugBank: 약에 관한 모든 정보
  * [[METLIN]]: 각종 생체활성분자들의 질량분석 정보

 * 실험정보 
  * TwoDiPage : Swiss2dPage
  * MicroArray : ArrayExpress, StanfordMicroArrayDatabase, [[GEO]]
  * [[QTL]] : PigQtlDb

 * 문헌정보
  * [[GO]] : QuickGo, AmiGo
  * Papers : PubMed, [[Scopus]], WebOfScience
  * diseases : [[OMIM]]

 * 통합정보
  * [[bioDBnet]]
  * [[CTD]]

=== Useful Information about Biological Database ===

 * MolecularBiologyDatabaseCollection
 * [[http://www.bioinformatics.pe.kr/link/database.html|Databases]] : In BioinformaticsInformation
 * [[http://bioinfo.sarang.net/data/varexp/virexp.html|생물DB를 이용하는 가상실험]]

=== Scripts for acessing Biological Database ===
 * [[PsiBlastQuery.rb]] - psi-blast를 biopython을 이용하지 않고 IE Automation을 이용한 무식한 방법 ([[Ruby]]이용)

=== Tools for bioinformatics ===
 * [[http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/valdar/scorecons_server.pl|The Scorecons Server]] : MSA sequence 정보를 이용해서 각 AminoAcid의 conservation score를 구해준다.

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이곳 BioinfoWiki에서는 InterWikiForBioinfo를 통해서, 각각 유용한 [[Database]]에 바로 접근할 수 있다.

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SeeAlso BioMart

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SubsetsOfBioinformatics CategoryDatabase