StrcutureBasedVirtualScreening을 하는데 중요한 요소이다. 

ligand와 receptor의 결합에너지의 순위(rank)를 정확히 예측할 수 있는 ConformationScoringFunction을 개발해야 한다.

다음과 같은 Scoring Function들이 알려져있다.
 * Force filed-based, 
 * empirical and knowledge-based, 
 * regression-based,