[[Genome]]에서 [[Gene]]의 위치 및 자세한 구조를 결정하는 과정 GenomeAnnotation의 과정. AlternativeSplicing 에 의해 총 몇개의 splice variant들이 생성되는가 까지 포함한다. 

보통은 다음의 방법들이 조합된다.
 1. AbInitio GenePrediction running
 1. [[BLAST]] result with 알려진 [[Gene]], [[EST]], [[Protein]]

SeeAlso GeneWise