aka [[GO]]. [[Gene]] [[Ontology]] consortium. They produce a dynamic controlled vocabulary that can be applied to all organisms even as knowledge of [Gene] and [Protein] roles in cells is accumulating and changing. One of the [[OBO]] http://www.geneontology.org/ http://www.godatabase.org/dev/ 그 시작은 각기다른 그룹의 모델생명체 [[Genome]]연구그룹들(FlyBase, [[SGD]], [[MGD]])의 공동연구에 기인한다. It is classified into three groups. * MolecularFunction * BiologicalProcess * CellularComponent Types of relationship * is-a * part-of * develops-from 이 세가지그룹은 통합된 의미를 지닌다. 어떤 [[Gene]] product는 하나이상의 MolecularFunction을 가지며(have), 하나이상의 BiologicalProcess에 사용되며(used in), 하나이상의 CellularComponent와 연관되어(associated with)있다. For example,the gene product cytochrome c can be described by the MolecularFunction term '''electron transporter activity''', the BiologicalProcess terms '''oxidative phosphorylation''' and '''induction of cell death''', and the CellularComponent terms '''mitochondrial matrix''' and '''mitochondrial inner membrane'''. [[GO]]는 [[DAG]]로 구조화된다. 단순한 hierarchies와의 차이점은 하나의 자식노드가 여러 부모노드를 가질 수 있다는 점이다. 마치 MultipleInheritance처럼. [[GO]]는 오로지 [[Gene]] product에만 초점을 맞춘다. 어떤 조직에서, 어떤 발생시기에 어떤 질병과 연관되어있는지등은 설명하지 않는다. 각각 목적에 맞는 ontology가 따로 개발되고 있다. See [[OBO]] [[GO]] [[Database]] * QuickGo * AmiGo Concerned paper * ''Saccaromyces'' [[Genome]] Database construction using [[GO]] (->) [[http://bioinfo.sarang.net/data/doc/dbinfo/sgd_go.pdf|SGD_GO]] 관련 프로그램 * [[GOM]] * GenBank id로부터 [[GO]] id를 [[Entrez]]를 통해 가져오기 : [[GoFromGiEntrez.py]] ([[cyppi]]씨 작성) ---- GO:0003673 in [[GO]] ---- CategoryDatabase