[[PMF]]. 펩타이드 질량 청사진으로 MinimalProteinIdentifier의 한가지가 될수 있다.

질량분석기술(MassSpectrometry)의 발달로 인해서, 그 분석대상 물질이 고분자인 [[Protein]]에 까지 가능하게 되었다. 이 질량분석기술을 이용한 단백질 동정방법중의 하나이다. 

[[Protein]]을 특정 제한효소처리하게 되면 조각조각으로 잘려지게 되는데, 이때 잘려지는 부위는 단백질이 가지고 있는 특정 서열에 의존한다. 따라서 단백질의 서열을 알고 있으면, 이론적으로 단백질 조각조각의 분자량을 예측 할 수 있다. 알려진 모든 단백질들의 서열에 대해 가상의 조각조각 분자량을 구한 뒤, 질량분석기술을 통해, 실제의 조각조각의 분자량과 비교한다. 여기서 알아낸 조각조각의 실제 분자량들을 PeptideMassFingerprint이라고 부르며, 단백질에 따라 이 정보가 매우 다르기 때문에, 단백질마다 unique한 정보가 되며, [[Proteomics]]에서 ProteinIdentification방법으로 널리 이용된다. 주로 [[MALDI-TOF]]장비를 사용한다. 

이 [[Algorithm]]을 SpectralAlignment라고 한다.

관련 프로그램들
 * Public
  * [[MOWSE]]
  * ProteinProspector (MS-Fit)
  * PeptIdent
  * ProFound
  * [[Mascot]]
 * Commercial
  * BioWorks
 * 종합검색
  * [[PeptIGate]]

각종 자료
 * 각 프로그램들의 성능비교는 다음 논문 참고 : AccessPerformanceProteinIdentificationAlgorithm
 * [[PMF]]시 각 펩타이드 조각들의 길이 분포 : PmfSimulation
 * GenomeBasedPeptideFingerprintScanning
 
시약에 의한 Cys,Met 변형

|| '''Modification''' || '''Reagent''' || '''Site''' || '''Mass Difference(Mono, Avg)''' ||
||Carbamidomethyl ||iodoacetamide || C || 57.03404, 57.072 ||
|| Carboxymethyl || iodoacetic acid  || C ||  58.00548, 58.037 ||
|| Propionamide ||  acrylamide || C || 71.03712, 71.079 ||
|| S-pyridylethyl  || 4-vinyl-pyridine ||  C || 105.05785, 105.139 ||
|| Oxidation || . ||  M || 15.99492, 15.999 ||