BiologicalDatabase about pig [[QTL]]

http://www.animalgenome.org/QTLdb/

Pig [[QTL]]에 대한 지난 10년간의 모든 자료를 모아놓았다. 현재(2005-06) 76개의 publication으로 부터 821개의 QTL이 만들어졌다. 이들은 225개의 서로다른 [[Trait]]들로 표현된다. 각각의 마커들은 [[NCBI]] [[UniSTS]]와 연동되어 있다.

사용자는 다음의 방법으로 엑세스할 수 있다.
 * Search : [[Chromosome]]별, [[Trait]]별, publish key-word 별 검색기능
 * Browse : [[Chromosome]]번호별, [[Trait]] [[Ontology]] tree 별 탐색기능

Trait 는 크게 다섯가지로 분류된다.
 * Meat quality
 * Health 
 * Exterior
 * Production
 * Reproduction

예를 들어, TNUM 이라는 trait는 {{{Reproduction(Trait class) - Reproductive organ(Trait types) - Number of nipples [TNUM] (Trait name [abbreviation]}}} 로 계층적 [[Ontology]]로 구성되어 있다. 

Top 10 Traits in thems of number of QTLs reported
|| '''Number of QTL''' || '''Traits''' ||
|| 44 || Backfat (Average) Thickness ||
|| 24 ||  Loin Eye Area ||
|| 23 ||  Color L ||
|| 17 ||  Body Weight At Birth ||
|| 17 ||  Backfat Thickness At Last Rib||
|| 16 ||  PH 24 Hours Post Mortem (Loin) ||
|| 16 ||  Intramuscular Fat Percentage ||
|| 15 ||  Carcass Length ||
|| 14 ||  Number Of Nipples ||
|| 11 ||  Backfat At Last Lumbar ||
|| 11 ||  Ovulation Rate ||

각각의 QTL들은 다음의 정보를 포함한다.
 * QTL description : symbol, trait, chromosome, center location, QTL span, Flanking markers, Test statistics, Dominance effect, Additive effect, Candidate gene, NCBI gene link
 * QTL experiment in brief : animal, design, analysis, software
 * Reference
 
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