<> == Protemics == === Introduction === [[Proteome]]이라는 용어는 한 개체의 [[Gene]] 전체를 [[Genome]]이라 하듯이 개체의 전체 [[Proteins]]라는 의미로 사용된다. 실제 이러한 용어는 [[Gene]]-[[Genome]], [[RNA]]-[[Transcriptome]], [[Protein]]-[[Proteome]], [[Metabolite]]-[[Metaboliome]] 의 과정으로 쓰여지며, 개체의 해당성분전체임을 의미한다. 이 학문을 [[Proteomics]]라고 하며, [[Genomics]]와 구분된다. 실제로 유전자발현의 최종산물인 [[Protein]]은 그 복잡성과 다양성으로 인하여 실제적으로 전체의 단백질, [[Proteome]]을 관찰하고 연구한다는 것은 매우 어려운 일로 생각되어져 왔으나, 최근의 TwoDiPage 실험방법의 발달 및 MassSpectrometry의 발달로 인하여 그 가능성이 엿보이면서 많은 분야에서 도전분야가 되고 있다. HumanGenomeProject의 성공적인 결과는 바로 [[Proteome]]의 이해의 필요성을 낳았고, 이에 전세계적으로도 방대한 [[Proteome]]의 세계로 생물학 연구 화두가 옮겨지고 있다. See BridgingGenomicsAndProteomics FunctionalGenomics와도 유사한 의미로 쓰인다. m[[RNA]]를 다룬다는 것이 차이이며, m[[RNA]]의 발현량이 [[Cell]] specific하다는것은 [[Proteomics]]와 같다. === Proteomics aims to === * Separate, identify and characterize proteins on a large scale(HighThroughPut, fully automatic) * Define levels of [[Proteins]] in [[Cell]]s / tissues and how these change * Investigate [[Protein]] complexes * Elucidate [[Protein]] functions, pathways, and interrelationships, modifications * SystemsBiology approach === 연구방법들 및 세분화 === * TwoDiPage, [[ICAT]] * MassSpectrometry * [[Proteins]] ExpressionProfile 관찰 * ProteinProteinInteraction * PostTranslationalModification * 궁극적으로 ProteinChip의 방향으로 나아가고 있다. === Major issues in Proteomics === * How can you separate and visualize the [[Proteins]] in a [[Proteome]]? * How can this be used to study [[Protein]] complexes and BiologicalPathway? * How can you quickly identify separated [[Proteins]]? * How can you characterize [[Proteins]] in detail? === Bioinformatics in Proteomics === * ImageProcessing of TwoDiPage gel image * ProteinIdentification (using MinimalProteinIdentifier) * pI/MW, AminoAcid composition * PeptideMassFingerprint * PeptideFragmentation * AccurateMassTag * Search against reference BiologicalDatabase * DeNovoPeptideSequencing in PostSourceDecay * Analysis of ExpressionProfile * ProteinNetwork === Etc. === 최근 CeleraGenomics에서는 연구방향의 많은 부분이 실제 [[Proteomics]]로 전환중에 있고, Target organism선정한것중에 이채로운 것이 나방류의 Proteomics이다. 이들이 말하길, ''One genome, a lot of proteome'' 이다. 하나의 genome으로 부터 발현되는 proteome은 초기 애벌레일때와, 나중 나방일때와 전혀 다를것이기에 이와같이 표현한것이고, 이 연구성과는 실제 하나의 genome이 어떻게 proteome의 발현양상을 조절할 것인가에 대한 궁금중을 해결할 것이다. 이런 패턴은 나방류뿐만이 아니다. 인간역시, 기관별, 조직별로 그 proteome이 매우 다르다. 따라서 어떤부분은 간으로서의 역할을 하기도 하고 어떤 부분은 뇌의 역할을 하기도 한다. 그러나 그 패턴의 현저한 변화는 나방류에 미치지 못할것임을 예측할 수 있다. === 관련도서 === * ProteomicsFromProteinSequenceToFunction * ProteomeResearchNewFrontiersInFunctionalGenomics * ProteomeResearchMassSpectrometry * ProteomeResearchTwoDiPageAndProteinIdentification === 관련정보 === 관련기관 * [[ExPASy]] * [[HUPO]] / [[KHUPO]] 그외 * TrendsInProteomics * WorksBase * [[Pyteomics]] SeeAlso SubsetsOfBioinformatics ---- == The Journal of Proteomics == {{http://download.interscience.wiley.com//jcovers/76510741/109596200.gif}} http://www.interscience.wiley.com/jpages/1615-9853/ [[Proteomics]] 저널 ---- CategoryJournalBioInfo