GeospizaInc에서 만든 [[Genome]]서열에서, RepetitiveSequence를 masking하는 프로그램. [[Perl]]로 쓰여져 있다.

http://www.repeatmasker.org

RepBase라는 repeated sequence [[Database]]가 필요하며, PhilGreen의 CrossMatch프로그램을 기반으로 제작되었다. HumanGenome의 경우 평균 50%이상이 masking된다.

CrossMatch대신에 WuBlast를 써서 속도를 개선한 MaskerAid도 있다. 

최근(2005-09) OpenSource버전으로 다시 배포된다. 서열검색엔진으로 다음 셋중의 하나를 선택할 수 있다.
 * CrossMatch
 * WuBlast
 * DeCypher 

같이 배포되며, 사용되는 ProcessRepeats 스크립트에서 STDERR에 쓰기를 남용하는듯. 에러났을 때나 써야지, 현재 상태의 프린팅에 쓰면, 관련 [[Unix]] 어플리케이션들이 같이 사용하고자 할때 해깔린다.

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CategoryProgramBio