[[SNP]]를 타이핑하기 위한 칩. [[WikiPedia:SNP_array]] 보통 백만개 정도의 SNP을 한번의 실험으로 알 수 있음. 이 실험결과를 관리하는 정보관리기술 * [[http://www.daimi.au.dk/~mailund/SNPFile/|SNPFile]] * [[http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0024982|SNPpy]] * [[http://www.stats.ox.ac.uk/~davison/software/shellfish/shellfish.php|Shellfish]] * [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2853754/|Using R]] ---- SNP array 데이터베이스를 만드는데 중간에 막힘. 대안은? 1. [[HDF5]]를 쓰면 충분할 것이라고 생각했는데, 저장상태(append) 검색기능을 쓰기 위해서는 HDF5가 777k 만큼의 컬럼수를 허용하지 않는다. 그 기능을 안쓰면 저장하는데 넘 오래 걸림. 'AA'를 0으로 바꾸는 작업도 매우 오래 걸림. 1. [[RDBMS]]도 고려해봤으나, 컬럼수가 최대 만개가 넘지 아니함. 관련정보 * [[http://www.biostars.org/p/12714/|database backed program for management of SNP data?]] -- [[yong27]] <> ---- Contents moved to http://e.biohackers.net/SNP_array