GenomeBrowser written in [Java]. [Ensembl] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [BDGP]의 한가지

http://www.fruitfly.org/annot/apollo/

주요기능

• Genome data 의 viewing 및 navigation
• 사용자가 직접 annotation을 추가할 수 있다. exon merging/split등등

• 특정 영역별 서열데이터(.fasta) 및 MultipleAlignment 데이터(.msf)를 따로 저장할 수 있다.

지원하는 입력 포맷

• [XML]
  • [GAME]
  • [Chado]
• [Ensembl]
  • GFF file
  • Direct [MySQL] connection to Ensembl

• GenBank

• [EMBL]
• Analysis result
  • [BLAST]
  • [Sim4]
  • [Blat]
  • [Fgenesh]

  • GenScan

  • [tRNAscan-SE]

  • RepeatMasker

CategoryProgramBio