Diff for "Apollo" - BioHackersNet

Differences between revisions 2 and 7 (spanning 5 versions)

GenomeBrowser written in Java. Ensembl DB를 Apollo로도 볼 수 있다. BDGP의 한가지

주요기능

지원하는 입력 포맷

-  ⇤ ← Revision 2 as of 2006-06-22 14:04:08 → 
  Size: 168
  Editor: 211
  Comment:
+   ← Revision 7 as of 2011-09-16 17:54:52 → ⇥
  Size: 736
  Editor: 211
  Comment:
-Deletions are marked like this.
+Additions are marked like this.
 Line 1:
-GenomeBrowser written in [Java]. [Ensembl] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [BDGP]의 한가지
+GenomeBrowser written in [[Java]]. [[Ensembl]] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [[BDGP]]의 한가지
 Line 5:
+주요기능
 * Genome data 의 viewing 및 navigation
 * 사용자가 직접 annotation을 추가할 수 있다. exon merging/split등등 
 * 특정 영역별 서열데이터(.fasta) 및 MultipleAlignment 데이터(.msf)를 따로 저장할 수 있다.

지원하는 입력 포맷
 * [[XML]]
  * [[GAME]]
  * [[Chado]]
 * [[Ensembl]]
  * GFF file
  * Direct [[MySQL]] connection to Ensembl
 * GenBank
 * [[EMBL]]
 * Analysis result
  * [[BLAST]]
  * [[Sim4]]
  * [[Blat]]
  * [[Fgenesh]]
  * GenScan
  * [[tRNAscan-SE]]
  * RepeatMasker