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| GenomeBrowser written in [Java]. [Ensembl] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [BDGP]의 한가지 | GenomeBrowser written in [[Java]]. [[Ensembl]] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [[BDGP]]의 한가지 |
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| http://www.fruitfly.org/annot/apollo/ | http://apollo.berkeleybop.org/ 주요기능 * Genome data 의 viewing 및 navigation * 사용자가 직접 annotation을 추가할 수 있다. exon merging/split등등 * 특정 영역별 서열데이터(.fasta) 및 MultipleAlignment 데이터(.msf)를 따로 저장할 수 있다. 지원하는 입력 포맷 * [[XML]] * [[GAME]] * [[Chado]] * [[Ensembl]] * GFF file * Direct [[MySQL]] connection to Ensembl * GenBank * [[EMBL]] * Analysis result * [[BLAST]] * [[Sim4]] * [[Blat]] * [[Fgenesh]] * GenScan * [[tRNAscan-SE]] * RepeatMasker SeeAlso WebApollo |
GenomeBrowser written in Java. Ensembl DB를 Apollo로도 볼 수 있다. BDGP의 한가지
http://apollo.berkeleybop.org/
주요기능
- Genome data 의 viewing 및 navigation
- 사용자가 직접 annotation을 추가할 수 있다. exon merging/split등등
특정 영역별 서열데이터(.fasta) 및 MultipleAlignment 데이터(.msf)를 따로 저장할 수 있다.
지원하는 입력 포맷
- GFF file
Direct MySQL connection to Ensembl
- Analysis result