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GenomeBrowser written in [Java]. [Ensembl] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [BDGP]의 한가지 GenomeBrowser written in [[Java]]. [[Ensembl]] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [[BDGP]]의 한가지
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 * [XML]
  * [GAME]
  * [Chado]
 * [Ensembl]
 * [[XML]]
  * [[GAME]]
  * [[Chado]]
 * [[Ensembl]]
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  * Direct [MySQL] connection to Ensembl   * Direct [[MySQL]] connection to Ensembl
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 * [EMBL]  * [[EMBL]]
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  * [BLAST]
  * [Sim4
]
  * [Blat]
  * [Fgenesh]
  * [[BLAST]]
  * [[Sim4]]
  * [[Blat]]
  * [
[Fgenesh]]
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  * [tRNAscan-SE]   * [[tRNAscan-SE]]

GenomeBrowser written in Java. Ensembl DB를 Apollo로도 볼 수 있다. BDGP의 한가지

http://www.fruitfly.org/annot/apollo/

주요기능

  • Genome data 의 viewing 및 navigation
  • 사용자가 직접 annotation을 추가할 수 있다. exon merging/split등등
  • 특정 영역별 서열데이터(.fasta) 및 MultipleAlignment 데이터(.msf)를 따로 저장할 수 있다.

지원하는 입력 포맷


CategoryProgramBio

Apollo (last edited 2013-05-21 08:27:04 by 61)

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