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GenomeBrowser written in [Java]. [Ensembl] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [BDGP]의 한가지 | GenomeBrowser written in [[Java]]. [[Ensembl]] DB를 Apollo로도 볼 수 있다. [[BDGP]]의 한가지 |
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* Direct [MySQL] connection to Ensembl | * Direct [[MySQL]] connection to Ensembl |
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GenomeBrowser written in Java. Ensembl DB를 Apollo로도 볼 수 있다. BDGP의 한가지
http://www.fruitfly.org/annot/apollo/
주요기능
- Genome data 의 viewing 및 navigation
- 사용자가 직접 annotation을 추가할 수 있다. exon merging/split등등
특정 영역별 서열데이터(.fasta) 및 MultipleAlignment 데이터(.msf)를 따로 저장할 수 있다.
지원하는 입력 포맷
- GFF file
Direct MySQL connection to Ensembl
- Analysis result