BioHackersNet|
Size: 1815
Comment:
|
Size: 1329
Comment: add Tips
|
| Deletions are marked like this. | Additions are marked like this. |
| Line 14: | Line 14: |
| ---- === Tips === 1. plug-in의 application software가 실행되지 않을때 |
|
| Line 15: | Line 18: |
| === AnswerMe === 전반적인 upload내용에 관한 파악을 하려고, demodataupload란 file을 받아서 적용시켜 보려 하는데, 압축을 풀면 3개의 폴더가 나오고 그 중 2개는 mysql database로 생성했던 base와 basedynamic file과 동일하고, 나머지는 /usr/local/base/data folder와 일치하는 것이었습니다.제가 궁금한 것은 demo file을 어떻게 upload시킬 수 있나하는 것입니다. data folder는 그냥 overwrite하면 될것 같은 데, mysql db는 어떻게 merge시킬지 잘 모르겠네요... -- ["terra19"] [[DateTime(2005-10-12T02:55:09Z)]] |
{{{ vi /usr/local/base/config.inc.php |
| Line 18: | Line 21: |
| '''"folder info"''' | $config["mysql.localinfile"]=0;에서 0을 1로 바꾼다. |
| Line 20: | Line 23: |
| demo_data file |-- base (mysql에 생성되어 있는 database) |
/usr/local/base/bin/base.server start |
| Line 23: | Line 25: |
| |-- basedynamic (mysql에 생성되어 있는 database) | 만약 이렇게해도 안되면, |
| Line 25: | Line 27: |
| |-- data (/usr/local/base/ 밑에 존재하는 folder) | mysql에서 base database에 있는 Job table의 내용들을 삭제한 후 재시작. delete from Job; }}} |
많은양의 MicroArray실험을 관리하면서 분석을 할수 있는 프로그램. 오프소스이며, 기반이되는 프로그램들도 오픈소스프로젝트 프로그램들임. MicroArray특성상 여러번의 실험을 하고, 다른 실험결과들 까지 다루게 되면 관리도 어려워질뿐만아니라 의미있는 데이터를 찾기가 어려워진다고.. 이럴때 필요한 프로그램.
BaseInstall -- 우분투에 BASE 설치하기.
[http://opensource.microarray.omrf.org/wiki/bin/view/BASE/BASEdBUsersGuide UsersGuide]
[terra19]님이 제게 알려주셨습니다. 약간 살펴봤는데, 상당히 많은 기능이 있는거 같습니다. -- ["cyppi"] DateTime(2005-07-25T08:04:47Z)
제가 실험실에 셋팅하고자 하는 시스템의 벤치마커로 생각하고 있습니다. -- ["terra19"]
Tips
1. plug-in의 application software가 실행되지 않을때
vi /usr/local/base/config.inc.php $config["mysql.localinfile"]=0;에서 0을 1로 바꾼다. /usr/local/base/bin/base.server start 만약 이렇게해도 안되면, mysql에서 base database에 있는 Job table의 내용들을 삭제한 후 재시작. delete from Job;