CalculatePiMwInTwoDiPage

TwoDiPage에서 pI, MW값 계산하기

Size marker들의 (MW, RM), pI marker들의 (pI, 위치)의 자료값을 이용하여 RegressionAnalysis나 보간법을 사용하여 함수를 유도한다. 여기서 유도된 pI, mw함수에 spot위치를 넣어서 실험적 pI, mw값을 알수 있다.

Molecular Weight

2D gel의 SDS-PAGE에서는 mw size marker를 사용하고 size marker의 위치는 relative mobility(RM)로 계산된다.

                           well로부터 marker까지의 길이
relative mobility  =  -------------------------
                          well로부터 dye front까지의 길이

분자량 도출을 위해 사용하는 RegressionAnalysis 모델은 다음과 같다. y는 분자량, x는 relative mobility

$\log(y) = a + bx + cx^2$

$\log(y) = a + bx + cx^2 + dx^3$

$\log(y) = a + bx$

$\log(y) = a + b \log x + c log(x^2)$

$\log(\ln(y)) = a + b\ln(-\ln(x))$

IsoelectricFocusing에서의 pI marker의 위치는 절대위치로 SimpleRegressionAnalysis를 사용하여 시료의 pI을 도출한다.

$$ y = a + bx $$

상용 pI gel strip을 사용할 경우 이미 길이와 pI range가 결정되어 있다.