Diff for "GraphViz" - BioHackersNet

Differences between revisions 7 and 18 (spanning 11 versions)

[Graph] visualization program

http://www.graphviz.org

그래프를 그리는데 몇가지 프로그램들이 있다.

dot : hierachical or layered drawing
neato : sprint model layouts
fdp : same neato, but different algorithm, it handles larger graphs and clustered undirected graph
twopi : radial layout
circo : circular layout

몇가지 팁

노드에 한글을 표시하고 싶은 경우 폰트이름을 지정해준다. ( node [fontname="Eunjin", fontsize="11"] ,예 [Baduk] )

SeeAlso GraphVizParser

토론

놀라운 경험. 이 프로그램을 쓰면, 다양한 [Interaction]들을 쉽게 그림으로 나타낼 수 있다. -- yong27 2005-12-11 17:19:23

좋기는 한데, 한계가 만만찮습니다. 대용량(노드수가 몇 백 개를 넘는다든지)은 자바쪽을 찾아보는 것이 낫더군요. --JuNe

노드수가 아주 많은 경우 Cytoscape 를 많이 사용합니다. Graphviz 처럼 CLI 가 있는지 모르겠지만, 자바로 제작되어 있고, 속도도 상당히 잘 나오고 그림도 다양하게 그릴 수 있습니다. Plugin 도 잘 구성이 되어 있고요 -- neosphere 2005-12-13 23:12:18

CategoryProgram

-  ⇤ ← Revision 7 as of 2006-04-19 11:38:57 → 
  Size: 1135
  Editor: 211
  Comment:
+   ← Revision 18 as of 2011-08-03 11:00:37 → ⇥
  Size: 1248
  Editor: localhost
  Comment: converted to 1.6 markup
-Deletions are marked like this.
+Additions are marked like this.
 Line 3:
-http://www.research.att.com/sw/tools/graphviz/
+http://www.graphviz.org
 Line 5:
-MoinMoin 용 dot 파서 사용가능
+그래프를 그리는데 몇가지 프로그램들이 있다.
 * dot : hierachical or layered drawing
 * neato : sprint model layouts
 * fdp : same neato, but different algorithm, it handles larger graphs and clustered undirected graph
 * twopi : radial layout
 * circo : circular layout
-Line 7:
+Line 12:
-{{{#!dot
digraph G {
    node [style=filled, fillcolor=white]
    yong27 -> cyppi -> neosphere ->  yong27
+몇가지 팁
 * 노드에 한글을 표시하고 싶은 경우 폰트이름을 지정해준다. ( {{{node [fontname="Eunjin", fontsize="11"]}}} ,예 [Baduk] )
-Line 12:
+Line 15:
-    // a comment
+SeeAlso GraphVizParser
-Line 14:
+Line 17:
-    yong27 [URL='yong27']   // link to an external URL
    cyppi [URL='cyppi']          
    neosphere [URL='neosphere']
    yong27 [fillcolor=blue]              
}
}}}
+== 토론 ==
놀라운 경험. 이 프로그램을 쓰면, 다양한 [Interaction]들을 쉽게 그림으로 나타낼 수 있다. -- [[yong27]] <<DateTime(2005-12-11T08:19:23Z)>>
-Line 21:
+Line 20:
-----
놀라운 경험. 이 프로그램을 쓰면, 다양한 [Interaction]들을 쉽게 그림으로 나타낼 수 있다. -- ["yong27"] [[DateTime(2005-12-11T08:19:23Z)]]
+좋기는 한데, 한계가 만만찮습니다. 대용량(노드수가 몇 백 개를 넘는다든지)은 자바쪽을 찾아보는 것이 낫더군요. --JuNe
-Line 24:
+Line 22:
-----
좋기는 한데, 한계가 만만찮습니다. 대용량(노드수가 몇 백 개를 넘는다든지)은 자바쪽을 찾아보는 것이 낫더군요. --JuNe
----
노드수가 아주 많은 경우 Cytoscape 를 많이 사용합니다. Graphviz 처럼 CLI 가 있는지 모르겠지만, 자바로 제작되어 있고, 속도도 상당히 잘 나오고 그림도 다양하게 그릴 수 있습니다. Plugin 도 잘 구성이 되어 있고요 -- ["neosphere"] [[DateTime(2005-12-13T14:12:18Z)]]
+노드수가 아주 많은 경우 Cytoscape 를 많이 사용합니다. Graphviz 처럼 CLI 가 있는지 모르겠지만, 자바로 제작되어 있고, 속도도 상당히 잘 나오고 그림도 다양하게 그릴 수 있습니다. Plugin 도 잘 구성이 되어 있고요 -- [[neosphere]] <<DateTime(2005-12-13T14:12:18Z)>>