Diff for "MpiBlast" - BioHackersNet

Differences between revisions 1 and 2

MPI Library 를 이용해서 병렬계산이 가능하도록 수정된 ["Blast"].

http://mpiblast.lanl.gov/

formatdb 를 할때 사용될 node수에 맞춰서 db를 나누어 준다. 적용되는 범위는 blastn, blastp, blastx, tblastn, and tblastx. 이며, PsiBlast, PhiBlast, RpsBlast 등의 프로그램은 db를 나눠서 계산하는 방법상 지원하는 것이 불가능하다. 또한 MegaBlast 도 지원하지 않는다.

-  ⇤ ← Revision 1 as of 2005-11-22 10:05:05 → 
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  Comment:
+   ← Revision 2 as of 2005-11-22 11:24:34 → ⇥
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 Line 1:
-Mpi Library 를 이용해서 병렬계산이 가능하도록 수정된 ["Blast"]. formatdb 를 할때 사용될 node수에 맞춰서 db를 나누어 준다. 적용되는 범위는 '''blastn, blastp, blastx, tblastn, and tblastx.''' 이며, '''PSI-BLAST, PHI-BLAST, RPS-BLAST ''' 등의 프로그램은 db를 나눠서 계산하는 방법상 지원하는 것이 불가능하다. 또한 MegaBlast 도 지원하지 않는다.
+MPI Library 를 이용해서 병렬계산이 가능하도록 수정된 ["Blast"].
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- * http://mpiblast.lanl.gov/
+http://mpiblast.lanl.gov/

formatdb 를 할때 사용될 node수에 맞춰서 db를 나누어 준다. 적용되는 범위는 '''blastn, blastp, blastx, tblastn, and tblastx.''' 이며, '''PsiBlast, PhiBlast, RpsBlast ''' 등의 프로그램은 db를 나눠서 계산하는 방법상 지원하는 것이 불가능하다. 또한 MegaBlast 도 지원하지 않는다.