서울의대 김주한교수님 연구실. KoreanBioinformatics 의 중심연구기관중 하나.
이 연구실에서 개발한 시스템들
GRIP : Genome Research Informatics Pipeline : a kind of BioDatabaseIntegration
Xperanto : DnaMicroArray [Database]
BioCANDI : DnaChip analysis N data intergration. Database-backed microarray analysis
- GOChase / GOTree : [GO] error correcting
- GOAnnotator : cluster 결과로 나온 gene lists 에 각각 GO annotation. cluster별로 유의하게 mapping 된 [GO]를 확인할 수 있다.
ChromoViz : DnaMicroArray 결과를 [Chromosome]에 매핑. 유전자가 근처에 있을수록 같이 발현할 확률이 높다. BioConductor의 R package로 사용가능.
ArrayXPath : DnaMicroArray 결과를 BiologicalPathway에 접목(cluster결과로 나온 gene lists에 대한 mapping도 가능)