Diff for "STR" - BioHackersNet

Differences between revisions 5 and 6

ShortTandemRepeat Short_tandem_repeat = [Microsatellite]

DNA Profiling 에 사용될 수 있는 [VNTR]의 한가지. 길이는 2~10반복이다.

다음과 같은 이유들로 [QTL]탐색 및 유전자지도작성을 위한 GeneticMarker로 각광받고 있다.

[Gene]의 전반에 걸쳐 많이 나타난다.
고도의 다형성을 가진다.
유전자에 무작위로 분포한다.
공우성(co-dominance) 유전양식을 따른다.
해당 [Locus]의 서열분석작업 자동화가 쉽다.

현재 HumanGenome에서 3000여개 이상의 MicroSatellite marker가 분리 및 등록되었다. 그 [Gene]의 [Locus]는 [STS]로 결정하여 [YAC]의 인접지도등의 물리 지도 작성에 이용한다. 모든 MicroSatellite marker의 정보는 [GDB]등에서 얻을 수 있다.

미국 CODIS 에서 개인식별에 사용하는 13개의 STR은 다음과 같다.

D3S1358
THO1
D21s11
D18s51
D5s818
D13s317
D7s820
D16s539
CSF1PO
vWA
D8S1179
TPOX
FGA

-  ⇤ ← Revision 5 as of 2009-06-12 10:47:22 → 
  Size: 434
  Editor: 218
  Comment:
+   ← Revision 6 as of 2009-06-12 10:48:57 → ⇥
  Size: 1150
  Editor: 218
  Comment:
-Deletions are marked like this.
+Additions are marked like this.
 Line 4:
+다음과 같은 이유들로 [QTL]탐색 및 유전자지도작성을 위한 GeneticMarker로 각광받고 있다.
 * [Gene]의 전반에 걸쳐 많이 나타난다.
 * 고도의 다형성을 가진다.
 * 유전자에 무작위로 분포한다.
 * 공우성(co-dominance) 유전양식을 따른다.
 * 해당 [Locus]의 서열분석작업 자동화가 쉽다.

현재 HumanGenome에서 3000여개 이상의 MicroSatellite marker가 분리 및 등록되었다. 그 [Gene]의 [Locus]는 [STS]로 결정하여 [YAC]의 인접지도등의 물리 지도 작성에 이용한다. 모든 MicroSatellite marker의 정보는 [GDB]등에서 얻을 수 있다.
-Line 20:
+Line 29:
+관련프로그램
 * ExcelMicrosatelliteToolkit