terra19/2006-08 - BioHackersNet

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2006-08-11

[http://www.biologynews.net/archives/2006/08/11/contagious_cancer_in_dogs_confirmed_origins_traced_to_wolves_centuries_ago.html contagious cancer in dogs confirmed origins traced to wolves centuries ago] -- Biology News Net
[http://www.biologynews.net/archives/2006/08/10/firstever_genomic_test_predicts_which_lung_cancer_patients_need_chemotherapy_to_live.html firstever genomic test predicts which lung cancer patients need chemotherapy to live] -- Biology News Net
- : 초기단계의 폐암 조직을 수술로 절제하여, mRNA를 추출한 후 MicroArray 실험을 통해, gene의 발현패턴을 분석하여 chemotherapy를 할것인가를 판단하는 것에 관한 연구가 임상시험단계에 들어갔다는 이야기. 이제 서서히 환자에 대해서 chip을 이용하기 시작하는 것 같다. 마지막 부분에 보통 MicroArray를 cancer에서 어떻게 실험하는 지에 관한 설명이 간단하면서도 잘 되어있는것 같다.

[http://www.biologynews.net/archives/2006/08/08/the_shape_of_life_research_sheds_light_on_how_cells_take_shape.html the shape of life research sheds light on how cells take shape] -- Biology News Net
- : "Chemical bonding and mechanical instability were responsible for the stripes."

[http://bangdoll.isloco.com/?page=2 Bio::Blogs에 관하여] -- SoapLife Blog
- : [Bioinformatics]와 ComputationalBiology에 관해 한달에 한번 추천할 만한 Blog의 내용을 포스트하는 것.

attachment:korean_ad.gif
- : 내가 BioHackersNet에 오면, GoogleAdSense는 대부분 영어에다 MicroArray의 광고가 전부였다. 그래서, 지난번 모임때 나는 한글광고는 거의 보지 못했다고 했는데, 바로 오늘 보게되어서 바로 캡쳐했다. [yong27]의 [대장금]관련 내용에서. 프랑스요리는 이해가가는데 법무법인은 무슨 관계가 있는지...

[http://medialab.egloos.com/d2006-08-03 - Tools needed to nevigate landscape of the genome] -- Media Lab Blog
- : 지난번 모임에서 [yong27]님께 GAVI에 관한 질문을 했었는데, 그 사용용도에 대해서 내가 잘못알고 있었다. local programe은 아니지만, 이런것이 필요하다는 것은 확실한것 같다.

[http://coolvoy.com/9 테터툴즈에서 원하는 스킨 티스토리에 적용하기] -- coolvoy.com
- : 지난번 모임에서 [yong27]님이 말씀하시던 것이 생각나서....

[http://www.biologynews.net/archives/2006/08/01/no_cell_walls_no_new_cancer_cells.html no cell walls no new cancer cells] -- Biology News Net
- : 새로운 cell이 만들어지려면, 기존의 cell이 분열하여 두개의 cell로 나누어지게 되고 이러한 과정은 CellCycle이란 mechanism에 의해 조절된다. 본 연구는 SREBP1란 단백질이 CellCycle과정 중에 새로운cell wall을 만드는 데 필요한 lipid의 합성을 조절하는 것을 발견하였다. 즉, SREBP1 단백질이 없으면 lipid를 만들 수 없고, lipid가 없으면 새로운 cell을 만들수 없기 때문에 정상 cell보다 비정상적으로 증식하는 cancer와 같은 질병을 치료하는 데, target이 될 수 있을 것이다.
  - cancer의 MicroArray data를 분석해 보면, cell의 증식에 관련된 gene들 뿐만아니라, 여러 metabolism에 관여하는 gene들의 발현이 증가하는 것을 볼 수 있는데, 이러한 내용과 연관이 있지 않을까 생각된다. -- ["terra19"] DateTime(2006-08-02T01:43:51Z)

[http://www.biologynews.net/archives/2006/07/31/penn_researchers_find_role_for_micrornas_in_angiogenesis.html penn_researchers_find_role_for_micrornas_in_angiogenesis] -- Biology News Net
- : 주로 Biology News Net의 기사를 여기에 적는 것은 매일 어떤 내용들이 올라와 있나 확인하기 때문이고, 또 하나는 다른 사람들의 연구 내용을 읽고, 간략하게 요약을 하므로써 연구에 관한 사고의 폭을 넓히고 새로운 아이디어를 얻으려하기 때문입니다.
  - 전체적인 내용은 microRNA가 angiogenesis와 관련이 있다는 것으로, 앞으로 microRNA가 cancer therapy의 target이 될 수도 있다는 이야기. oncogene으로 알려진 MYC가 Petri dish에서는 inactive하고 animal model에서는 hyperactive해지는 것에 대하여 의문을 가지고 연구를 시작하게 되었고, MicroArray method를 이용하여 192개의 pro- or anti-angiogenesis molecule이 있거나 없을때 MYC가 있는 cell과 없는 cell에서의 mRNA을 변화를 확인하였다. 그 결과 thrombospondin-1 protein과 연계되어 anti-angiogenesis molecule들을 억제하는 것으로 확인 되었다. 즉, angiogenesis의 속도가 늦춰지는 것을 막는다는 것. MYC가 microRNA의 중요한 regulator로 작용하고 miR-17-92라는 microRNA cluster를 발견하여, MYC와 thrombospondin-1간의 연결고리를 발견하게 되었다.

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