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[Algorithm]
 1. [Genome] sequence 에 대해 [Fgenesh], GenScan, HmmGene를 각각 수행한다.		 [[Algorithm]]
 1. [[Genome]] sequence 에 대해 [[Fgenesh]], GenScan, HmmGene를 각각 수행한다.
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 1. 각 reading frame 하에서 exon의 집합의 score가 최대가 되는 집합을 찾는다. BayesianInference를 이용하여 score를 계산하고, [HMM]을 이용하여 exon 집합을 검색한다.  1. 각 reading frame 하에서 exon의 집합의 score가 최대가 되는 집합을 찾는다. BayesianInference를 이용하여 score를 계산하고, [[HMM]]을 이용하여 exon 집합을 검색한다.

DigitIntegratesGeneIdentificationTools. AbInitio [Gene]-finder that finds genes by combining GenePrediction from multiple AbInitio gene-finders such as [Fgenesh], GenScan, HmmGene.

Algorithm

  1. Genome sequence 에 대해 Fgenesh, GenScan, HmmGene를 각각 수행한다.

  2. 가능한 모든 exon들에 대해 각각 reading frame과 score를 부여한다.

  3. 각 reading frame 하에서 exon의 집합의 score가 최대가 되는 집합을 찾는다. BayesianInference를 이용하여 score를 계산하고, HMM을 이용하여 exon 집합을 검색한다.

5Mbps미만의 서열에 대해 웹상에서 분석결과를 제공한다. (RepeatMasker "-l" 옵션으로 repeat제거된 상태여야함)

CategoryProgramBio

DIGIT (last edited 2013-08-28 08:48:20 by 61)

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