Large Sequence간의 효율적인 Alignment를 위해 TIGR에서 개발한 프로그램.

SuffixTree를 이용하여 빠른 속도로 긴 서열을 매칭시키는 것이 특징이다. 5Mbps 정도의 두 서열을 매치시키는데 13초 정도 걸린다고.

http://www.tigr.org/software/mummer/

관련 paper : [http://bioinfo.sarang.net/moin/wiki/upload/MUMmer.pdf]

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