BioHackersNet1차원적인 DNA서열을 보고, Protein 코딩부분을 예측할 수 있다. 여기서의 코딩부분은 start codon 부터 stop codon까지. 이러한 Protein 후보 영역들을 OpenReadingFrame 라고 한다.
일반적으로 같은 stop codon을 사용하나 다른 start codon을 쓰는 많은 overlapping ORF가 있으며, 여기서 Maximal ORF를 ORF라고 칭하기도 한다.
따라서, 하나의 real gene에는 여러개의 ORF가 있을 수 있다. 여기서 non-coding ORF와 real gene를 구분하는 것이 생물정보학적 문제에 해당되며, High order MarkovChain등이 사용된다.
ORF prediction --> GenePrediction