One of the method to model Motif.

서열의 길이만큼 가로로 들여놓고, 세로에는 AminoAcid or NucleicAcid를 적고, 이들의 출현빈도를 적어놓은 Matrix. 이것을 단백질 [Profile]이라고 표현하기도 한다.

RegularExpression can only express choices. Different weight can be given to each AminoAcid depending on the position.

If gap are allowed, a DynamicProgramming approach is needed.