RNA polymerase가 특이적으로 결합하여 Transcription을 시작하는 DNA상의 영역.
기본적인 크기는 대장균 프로모터에는 약 60염기쌍이 있다. Promoter에 따라서 TranscriptionFactor가 작용하는 부위가 있고, 그 부위는 Promoter에 따라 다르지만 대장균의 Lactose-Operon에서는 고리모양 AMP 수용단백질이 촉진인자로 되어 프로모터에 인접하는 약 20염기쌍의 영역에 결합한다. 따라서 전체적으로 약 80염기쌍이 전사의 개시에 관여한다.
다수의 프로모터에 대해서 염기배열이 결정되고, 전사개시기능과의 관련이 해석되어있다. 배열은 Promoter의 종류에 따라 다르지만 일부 consensus한 부분이 있다.
원핵세포에는 PribnowBox가 잘 알려져 있으며, 진핵세포에는 RnaPolymerase 2가 직접 바인딩하는 TataBox와 한참 윗부분에서 발견되는 주로 TranscriptionFactor가 바인딩하는 GcBox가 있다.
미지의 서열에서 Promoter를 예측하는 문제는 잘 알려진 생물정보학 문제 : PromoterPrediction