BioHackersNetPdbFormat을 3차원으로 보여주는 프로그램. 유사한 프로그램으로 Chime이 있다.
일반메뉴
- File : open(원하는 pdb, ent 화일을 불러옴), information(불러온 파일의 정보), close(다음화일을 볼때는 반드시 닫아야함) print(현재화면을 프린트)
- Edit : 불러온 파일을 클립보드로 복사하거나 편집
Display : Wireframe(철사구조), Backbone(뼈대구조), Sticks(막대기구조), Spacefill(공간구조), Ball & Sticks(공,막대기구조), Ribbons(리본구조), Cartoons(그림구조)
- Colours : 분자구조의 색깔을 지정. monochrome(단색), CPK(흰색-C,H 빨강-O, 파랑-N, 노랑-P), group(작용기별로 다른색깔 표시), structure(2차구조별로 다른색표시)
- Option : 분자구조를 보는 각종 옵션 (stereo, specular 등등)
- Export : 현재보고있는 모습을 각종 확장자별로 그림화일, 혹은 다른 형태로 저장(bmp, gif, epsf, ppm, rast)
지원 File
PDB : Brookheven databank (PdbFormat)
- ALC : Alchemy file format
- MDL : Sybyl mol2 format
- MOL : mol file format
- ENC : enc file format
토론
안그래도 얼마전에 RasMol 쓰는 법을 알아보던 중 이었는데... input file이 어떻게 생긴건가요? PdbFormat 중에서 3차원 하나를 복사하고 나서 그냥 워드패드에 붙인 후 확장자만 pdb로 바꿨는데 맞나요? RasMol을 실행 시키고 나서 file open을 하니까 또 commandline 창이 하나 더 열리는데 그 다음을 모르겠는데... 어떻게 하는 겁니까?...........DrPepper
커맨드 창은 따로 입체구조를 어떻게 회전하라 등의 명령을 손수 내리는건데, 자세한 사항은 메뉴얼(; 죄송..)을 참고하시고요... 그냥 보실때는 커맨드창이 필요 없습니다. pdb포맷파일을 열면 바로 입체구조가 보입니다. --[yong27], 2004-03-30