Diff for "RepeatMasker" - BioHackersNet

Differences between revisions 2 and 3

GeospizaInc에서 만든 [Genome]서열에서, RepetitiveSequence를 masking하는 프로그램. [Perl]로 쓰여져 있다.

RepBase라는 repeated sequence [Database]가 필요하며, PhilGreen의 CrossMatch프로그램을 기반으로 제작되었다. HumanGenome의 경우 평균 50%이상이 masking된다.

CrossMatch대신에 WuBlast를 써서 속도를 개선한 MaskerAid도 있다.

최근(2005-09) open버전으로 다시 배포된다. 서열검색엔진으로 다음 셋중의 하나를 선택할 수 있다.

-  ⇤ ← Revision 2 as of 2005-09-08 15:41:45 → 
  Size: 454
  Editor: 203
  Comment:
+   ← Revision 3 as of 2005-09-12 14:49:16 → ⇥
  Size: 627
  Editor: 211
  Comment:
-Deletions are marked like this.
+Additions are marked like this.
 Line 7:
-CrossMatch대신에 WuBlast를 써서 속도를 개선한 MaskerAid도 있다.
+CrossMatch대신에 WuBlast를 써서 속도를 개선한 MaskerAid도 있다. 

최근(2005-09) open버전으로 다시 배포된다. 서열검색엔진으로 다음 셋중의 하나를 선택할 수 있다.
 * CrossMatch
 * WuBlast
 * DeCypher