StatisticalMethodsInBioinformatics Chap.9 [BLAST]

Introduction

이전쳅터의 RandomWalks, SequentialAnalysis를 이용하여, [BLAST]의 성질을 통계학적으로 이해하는데 본 쳅터의 목적이 있다. 이장에서 설명하는 [BLAST]는 V1.4로서 현재 널리쓰이는 버젼보다 오래된것이며, gap을 허용하지 않는다.

The comparison of two aligned sequences

The comparison of two unaligned sequences

The comparison of a query sequence against a database

Printouts

Minimum significance lengths

[BLAST]: A parametric or a nonparametric test?

Relation to SequentialAnalysis

Further developments of BLAST and further theory