Diff for "WaterModel" - BioHackersNet

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Biomolecule에 대한 MolecularDynamics in explicit system 을 수행할 때 고려해야 할 사항.

TIP3P, TIP4P, TIP5P, SPC/E, SSD/E, and SSD/RF 의 6가지 모델이 있는데, 이 중에서 TIP3P 더 선호하여 이용한다고 함. H-O-H각도가 104도이며, structural and thermdynamic properties가 다른 것보다 우수. 특히 CHARMM에서 biomolecule 에 대한 parameter를 개발할 때 TIP3P를 이용했다고 함. TIP4P는 TIP3P와 거의 비슷하나 diffusion property가 더 개선된 model.

어렵다. TIP3P가 좋은 거라니 그걸로 쓰고 있긴 하지만.. -["ghost"]

실제는 저 각도가 108도 아니였나? 왜 다른거지? -- ["yong27"] DateTime(2005-09-13T06:44:09Z)

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  Editor: 211
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-TIP3P, TIP4P, TIP5P, SPC/E, SSD/E, and SSD/RF 의 6가지 모델이 있는데, 이 중에서 TIP3P 더 선호하여 이용한다고 함.
H-O-H각도가 104도이며, structural and thermdynamic properties가 다른 것보다 우수.
특히  CHARMM에서 biomolecule 에 대한 parameter를 개발할 때 TIP3P를 이용했다고 함. 
TIP4P는 TIP3P와 거의 비슷하나 diffusion property가 더 개선된 model.
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+TIP3P, TIP4P, TIP5P, SPC/E, SSD/E, and SSD/RF 의 6가지 모델이 있는데, 이 중에서 TIP3P 더 선호하여 이용한다고 함. H-O-H각도가 104도이며, structural and thermdynamic properties가 다른 것보다 우수. 특히  CHARMM에서 biomolecule 에 대한 parameter를 개발할 때 TIP3P를 이용했다고 함. TIP4P는 TIP3P와 거의 비슷하나 diffusion property가 더 개선된 model.
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--어렵다. TIP3P가 좋은 거라니 그걸로 쓰고 있긴 하지만..  -["ghost"]
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어렵다. TIP3P가 좋은 거라니 그걸로 쓰고 있긴 하지만..  -["ghost"]
 ''실제는 저 각도가 108도 아니였나? 왜 다른거지?'' -- ["yong27"] [[DateTime(2005-09-13T06:44:09Z)]]