2007-05-15

• doe jgi sets gold standard for metagenomic data analysis -- Biology News Net

{{| "DOE JGI and our collaborators have pioneered the use of DNA sequencing-based technologies to understand microbial communities through a combination of computational and experimental methods," said Konstantinos Mavrommatis, lead author of the paper and a post-doctoral fellow in DOE JGI's Genome Biology Program. "We are now exploring ways to analyze metagenomic data to enable accurate classification of sequence fragments into their corresponding species populations. The goal is to reconstruct metabolic pathways by comparing with reference isolate genomes, so that we can model ecosystem dynamics using metabolic reconstructions of metagenomic data. |}}

• FAMeS: Fidelity of Analysis of Metagenomic Samples

2007-05-11

• worlds leading scientists announce creation of encyclopedia of life -- Biology News Net

{{| Many of the world’s leading scientific institutions today announced the launch of the Encyclopedia of Life, an unprecedented global effort to document all 1.8 million named species of animals, plants, and other forms of life on Earth. For the first time in the history of the planet, scientists, students, and citizens would have multi-media access to all known living species, even those that have just been discovered. |}}

• : [EncyclopediaOfLife]은 지구상에 있는 모든 생명체에 관한 정보를 모아서 정리하는 곳이라 할 수 있다.

2007-05-01

• reversing_cancer_cells_to_normal_cells -- Biology News Net

{{| Now, in the American Association of Anatomists’ plenary lecture and symposium, at Experimental Biology 2007 in Washington, DC, Dr. Hendrix describes new research that used an innovative experimental approach to provide unique insights into how scientists can change human metastatic melanoma cells back to normal-like skin cells - by exposing the tumor cells to the embryonic microenvironment of human embryonic stem cells, the zebra fish and the chick embryo. |}}

• : [Cancer]는 정상세포와는 다르게 비정상적인 증식을 하고, 주변의 정상세포와는 다른 형태의 모습을 가지고 있다. 이런 특징들은 [StemCell]과 비슷한 데, 다만 [StemCell]의 경우에는 그런 특징들이 잘 조절된다는 점이다. 위의 내용은 [Cancer]가 [StemCell]에서 분비되는 Nodal이란 단백질을 분비하며, Nodal의 발현을 억제하였더니, 정상에 가까운 세포로 변화되었다는 것이다. 만약, 위의 내용이 사실이라면 [Cancer]를 치료하는 데 있어서 획기적인 도움이 되리라 생각된다. 그 이유는 여태까지의 연구에서는 한번 [Cancer]가 되어 침윤이나 전이의 능력을 갖게 되면, 정상세포로 돌아갈 수 없다는 것이 알려져 있었는데, 만약 다시 정상적인 세포로 회기 시킬 수 있다면, 치료가 어려웠던 말기 환자의 치료가 가능하기 때문이다.

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