BlastExtendRepraze

http://www.tigr.org/edutrain/training/annotation_engine.shtml

TIGR사에서 미생물 GenomeAnnotation전략시 서열 homology검색에 BLAST대신 쓰고자 하는 확장형 프로그램

기존BLAST는 만일 Gene부위에서 시퀀싱에러에 의한 framshift 발생시 Gene을 두개로 인식하는 문제가 있다. 따라서 blastx수행시 앞뒤 얼마정도까지 커버하면서 검색하는 방법을 이용한다.

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