본 스터디의 목적은 BioPython의 활용을 극대화하기 위한 메뉴얼이해, 소스코드분석, 활용예제, 팁을 공유하는 것이며, 더 나아가 Biopython개발에 동참하는 것입니다.

Contents

  1. 공지사항
  2. Translation
  3. Code Analysis
  4. Biopython Application Example
  5. 논의

공지사항

  • 페이지이름을 만들때

    • BioPython에만 국한된 내용일 경우, 어두에 Biopython을 첨가하도록 합시다.

    • 소스코드가 필요할 경우는 .py의 확장자를 그대로 붙혀서 사용하고, 문두에 "#format python" 을 첨가합니다.

  • Tip에 해당되는 사항들은 BioPythonTip에 HierarchicalWikiWiki형태로 기록합니다.

Translation

Code Analysis

Biopython Application Example

논의

안녕하세요. 저도 같이 하고 싶어요.. 그래도 될까요? --destine

  • 물론입니다. 지금진행중인 문서화에 참여하셔도 되고요, 새로 만드셔도 됩니다. 자유롭게 참여하세요 --yong27

벌써 시작하셨군요.. :) 와.. 하늘가님 속도 굉장히 빠르시다.. 그런데 존칭은 생략하는게 좋지 않을까요? --picxenk

picxenk님 반가와요. 그리고 존칭 문제는 사실 장난으로 해봤어요. 어차피 우리가 책을 만드는 것도 아니고 공부하는데 도움만 되면 되는 거니까 각자 개성에 맞게 해도 괜찮지 않을까 싶어서. 존대말을 하건 반말을 하건 욕을 하건... 아니다. 욕하면 욕먹겠구나. 하하. 공식적인 문서는 존칭을 생략하는게 좋겠죠. 나머지 부분은 생략하기로 하죠. --SangeunChi

회사업무중 StandAloneBlast를 자동화해야할 일이 생겼습니다. 이분야를 중심으로 코드분석 및 활용예제를 싣도록 하겠습니다. 더불어서 Biopython 숙제하면서도 필요한 내용들을 적어야 할듯... --yong27

BioPython version 1.00a3으로 업해봤습니다. 그냥 덮어씌운거죠(윈도용). 그랬더니, [BioPythonTutorial/CookBook/Blast]에 소개된 error가 안나옵니다. 쩝.. --yong27

전 요즘 학교 알바로 약간 늦게 작업에 들어갈거 같습니다. 벌써 많이들 하셨네.. --picxenk

<!> 분량이 분량이니 만큼 작업을 하고있는 동안 에디트 창을 오랜시간 열어 둘 때가 있습니다. 그런데 간혹 다른 분이 잠깐 메모를 남기면 이전에 작업을 하는 사람은 저장하면서 상당히 당황하게 됩니다.. :) 우선 맡은 페이지에 대해서는 전적으로 맡기고 요청할 사항이나 메모할 사항은 다른 페이지에 언급하는 것이 좋을 거 같습니다. --picxenk

<!> 또 추가로 생각해야 할 문제는 우리가 여기서 하는 작업이 다른 포맷으로도 호환이 되도록 해야 한다는 것입니다. 좋은 예로 리눅스 문서 프로젝트의 DocBook이 있습니다. 누군가 모인모인 문서를 자동으로 DocBook이나 HTML 같은 문서로 변환하는 스크립트를 짜는 것은 어떨지... :)

  • 누구라 함은 yong27 님과 picxenk님 두분 중의 한 분이겠군요. 난 할 줄 몰라여. ㅋㅋ. Parser 를 만들어야 하나요? 모인모인 문서를 XML 같은 걸로 바꾸는 건 아직 없나? --SangeunChi

    • DocBook을 함 보긴했는데.. 으힛..아직 전 엄두가 안나네요... 이 문제는 좀 두고두고 고민해도 될듯 싶습니다만... 바로 picxenk님이 만들어두 되구.. --yong27

Biopython과 관련해서 '마이크로소프트'잡지 원고를 방금 썼습니다. 원고를 벌써 보냈지만 읽어보시고 이상한 거 있으면 알려주세요.. :) [LabStoryOfMrK] --picxenk

  • 와! 멋지군요! 잘 된 것 같은데요. 노스모키안들이 마소에 자주 나와서 정기구독 해야겠다. --SangeunChi

    • 헉... 저도 마소에 기사싣는 작업때문에 딴일에 손못대고 있습니다. picxenk님 글 넘 잘썼다.. 후후.. 내글은 워낙 딱딱해서리 재미가 영없는데... 제가 쓴 내용도 올릴께요.. MakeRdbUsingBioPython --yong27

      • 잘 읽었습니다. 그런데 모두 올리지 않으시고, Biopython과 관련된 부분만 올리셨네요.. 다 읽어보고 싶은데.. 그리고 ProtBench 프로젝트 흥미있네요.. 큰 연관은 없지만 http://www.labbook.com 사이트도 참고해보세요.. :) --picxenk Thank you~ ProtBench 전체문서는 공동저작물 성격이 강한관계로.. 잡지나오면 봐여..

BTC숙제는 잘 되가시는지요... 저는 일단 3번에서 막혔습니다. SangeunChi님과 비슷한 부분..; 시간도 안나고.. 게으르고.. 맘은 앞서는데, 되는일은 없고.. 요즘 우울함다..흑.. 그래도 마감기한까지 최선은 다해야겠죠? picxenk님 SangeunChi님 모두 화이팅... 하다가 막히는것들 있으면 좀 상의하며 합시다!! --yong27

요즘 학교 리눅스 서버가 연쇄적으로 해킹을 당해서 고생하고 있습니다. 겨우 해킹 증거들과 흔적들을 발견을 했지만, 언제 복구하고 작업할지 까마득합니다.. 형용이형.. 서버 리눅스 쓰시죠?? 조심하세요.. :) --picxenk

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