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[BioPythonTutorial/Advanced] |
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Chap 4.4 SubstitutionMatrix
Contents
SubsMat
이 모듈은 [BLOSUM], [PAM] matrix등과 유사한 [SubstitutionMatrix]를 생성해내는 몇몇 루틴과 클래스를 제공한다. 여기서의 matrix들은 사용자 제공 데이터에 기준한 것이다. 참고로 MatrixInfo.py에서 적당한/잘 만들어진 matrix를 선택할 수 도 있다.
class SeqMat(UserDict.UserDict)
- 속성들
- self.data :
- self.alphabet :
- self.ab_list :
- self.sum_letters :
- 메쏘드들
init
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