[Bioinformatics] Vol.17 no.6 2001 11395429

• 원본

• 반론

아래와 같은 문제를 제기하고, 그에 대한 verification시도. 결론은 SwissProt은 믿지못할 Database이다. 차후, [EBI]에서 Technical comment를 제시.

문제제기

1. 실험적으로 결정된 SwissProt의 function에 대해, Computational하게 계산된 function을 통해 ProteinIdentification을 믿음직하게 할 수 있는가?

2. translated GenBank (GenPept)과 SwissProt, TrEmbl사이에는 일관성이 있는가?

결론

1. SwissProt does not identify a significant number of experimentally characterized proteins

2. SwissProt lacks many proteins from full genomes of import organisms,

3. even if SwissProt + TrEmbl

4. GenPept do not exactly match the corresponding SwissProt

   • For example in E.coli, 80.6% match, 13.4% substring match, 4.1% only using [BLAST] match, 2.0% no match

technical comment by [EBI]

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