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Reverse - NorthernBlot. One of the MicroArray (GeneChip, DnaChip이란 용어로도 사용된다.)
Microscopic arrays of large sets of DNA sequences immobilized on solid substartes; cDNA or oligo chips containing all or a large fraction of genes in an organism.
DnaMicroArray의 종류
c[DNA]를 심어놓고, ExpressionProfile연구
oligonucleotide를 심어놓고, ExpressionProfile, hybridization, OligoNucleotideFingerprint, [SNP]연구
Useful Links about DNA Microarray
관련서적
관련프로그램
cDNA oligomer 선별 프로그램 : OligoPicker
- [BASE]
상용프로그램
ArraySuite ([Affymetrix])
ImaGene (Biodiscovery)
GeneSite (Biodiscovery)
- Spotfire (Spotfire)
- Resolver (Rosetta)
LifeArray (Incyte)
Expressionist (GeneData)
GeneExpress (Gene Logic)
IplabMicroArraySuite (Scanalytics)
공개프로그램
- J-Express (U Bergen)
- UCI/NCGR (UCI/NCGR)
TreeView (Standford)
- EPCLUST ([EBI])
- SOM (Whitehead inst)
Reference RNA
단순한 한 쌍의 비교 실험이 아닌 서로 다른 여러개의 실험 data들간의 유전자 발현정도를 일관성 있게 비교하기 위해서는 일정한 기준이 되는 RNA (universal reference)가 필요함; 실험에 사용된 모든 RNA들의 동일한 mixture로 구성된 양질의 RNA --> 가장 이상적인 reference RNA는 실험에 사용된 chip상의 모든 유전자 probe를 cover하는 target RNA
RNA 선형증폭
소량시료의 DNA microarray 실험이 증가하다. 따라서 증폭기술이 필요.
- signal 증폭 : Genisphere
선형증폭 : IVT technology (General; Agilent, Affymetrix, CodeLink, etc1, High-heel (GenomicTree)