EST와 유사하나, 얻게되는 과정이 cDNA를 통하지 않고 Genome으로부터 직접 얻어진 서열. exon trapped products와 gene trapped product로 구분된다. RnaSplicing이 일어났을 수도 있으므로, 원래 레코드와 차이가 있을 수 있다.
GSS는 다음의 데이터들을 포함한다.
- random "single pass read" genome survey sequences.
- exon trapped genomic sequence
- transposon-tagged sequences