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[Nature] vol 440, 23 March 2006, [KRIBB] 박홍석 박사, [todaewon]님 참여, [[Nature]] vol 440, 23 March 2006, [[KRIBB]] 박홍석 박사, [[todaewon]]님 참여,
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HSA11은 HumanGenome의 4.4% 정도에 해당된다. 최초로 위치가 알려진 [Gene]인 HemoGlobin bege gene(11p15.5)가 있는 염색체이다. 꽤 많은 유전자들을 포함하고 있다. (1,2,19번 다음으로 많다.) [DIGIT]이라는 AbIntio GenePrediction을 이용했다. HSA11은 HumanGenome의 4.4% 정도에 해당된다. 최초로 위치가 알려진 [[Gene]]인 HemoGlobin bege gene(11p15.5)가 있는 염색체이다. 꽤 많은 유전자들을 포함하고 있다. (1,2,19번 다음으로 많다.) [[DIGIT]]이라는 AbIntio GenePrediction을 이용했다.
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|| '''[Chromosome] property''' || '''Value''' || || '''[[Chromosome]] property''' || '''Value''' ||
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|| MicroRna || 12 ||
|| [snoRNA] || 27 ||		 || [[miRNA]] || 12 ||
|| [[snoRNA]] || 27 ||
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 1. Class 1 : 어류등에 존재했을 수용성 리간드를 위한 리셉터. HSA11에는 약 50%가 온전히 남아 있다. 이 영역은 beta-[Globin] cluster등에 의해 침범당하고 있다.  1. Class 1 : 어류등에 존재했을 수용성 리간드를 위한 리셉터. HSA11에는 약 50%가 온전히 남아 있다. 이 영역은 beta-[[Globin]] cluster등에 의해 침범당하고 있다.
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[DIGIT]는 다양한 GenePrediction 프로그램들을 조합하여 사용하는데, 서열유사도를 쓰지 않음으로써, 극도로 드믄 예측정도도 잠재적으로 예측해 낼 수 있다. [[DIGIT]]는 다양한 GenePrediction 프로그램들을 조합하여 사용하는데, 서열유사도를 쓰지 않음으로써, 극도로 드믄 예측정도도 잠재적으로 예측해 낼 수 있다.

Nature vol 440, 23 March 2006, KRIBB 박홍석 박사, todaewon님 참여,

  • Human chromosome 11 DNA sequence and analysis including novel gene identification

논문 및 기사

HSA11은 HumanGenome의 4.4% 정도에 해당된다. 최초로 위치가 알려진 Gene인 HemoGlobin bege gene(11p15.5)가 있는 염색체이다. 꽤 많은 유전자들을 포함하고 있다. (1,2,19번 다음으로 많다.) DIGIT이라는 AbIntio GenePrediction을 이용했다.

HSA11 종합 정리

Chromosome property

Value

전체 길이 (bp)

134,452,384

결정된 길이 (bp)

131,130,853

알려진 단백질코딩 [Locus]

1,195

신규 " "

104

신규 transcripts

221

반복유전자

4

Pseudogenes

765

tRNA

19

miRNA

12

snoRNA

27

Gene coverage

46.94%

exon coverage

2.70%

후각 리셉터 유전자는 후생동물계(metazoan)에 multi-gene family 로 존재한다. HumanGenome에는 20, Y를 제외한 모든 염색체에 포함되어 있다. 대개가 하나짜리 엑손 유전자이며 평균길이는 약 1kb. HSA11에는 369개의 좌위가 발견되었는데, 이중 55%는 psedogene이다. 크게 두 분류로 나눌 수 있다.

  1. Class 1 : 어류등에 존재했을 수용성 리간드를 위한 리셉터. HSA11에는 약 50%가 온전히 남아 있다. 이 영역은 beta-Globin cluster등에 의해 침범당하고 있다.

  2. Class 2 : 공기중 성분 감지 리셉터. mouse, rat, dog등에도 유사한 cluster가 있으나 인간의 것은 매우 다름. centromere에 의해 분리되었으며, 구조적 변화가 있음에도, 설치류의 것과 그 순서가 유지되고 있다는 점 등으로 미루어볼때, 공통조상으로부터 유래되었으리라 추정된다.

DIGIT는 다양한 GenePrediction 프로그램들을 조합하여 사용하는데, 서열유사도를 쓰지 않음으로써, 극도로 드믄 예측정도도 잠재적으로 예측해 낼 수 있다.

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HumanChromosome11DnaSequenceAnalysis (last edited 2011-08-08 15:53:50 by 211)

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