Diff for "PrimerDesign" - BioHackersNet

Differences between revisions 2 and 3

[Primer] [Design]. [PCR]을 통해 특정서열을 증폭해내고자 할때, 원하는 서열을 콕 집어내려면, 서열을 보고 적절한 primer를 디자인해야한다.

약 18-24mer의 oligomer서열과 Tm값을 계산해낼 수 있다. annealing온도의 몇도차이가, 현저한 [PCR]결과를 만들어낸다.

20base이내인 primer의 Tm값은 다음공식으로 계산될 수 있다.

$$ T_m = 4(G+C) + 2(A+T) $$

그 이상의 길이에 대해서는 NearestNeighobr계산이 필요하다.

Primer내에 적당한 GC contents가 필요하다. 이 GC함량과 Tm과 값을 잘 맞추어야한다.

[PCR] 생성물의 길이는 PCR 증폭시 그 효율성에 상당히 영향을 준다. 생성물의 길이는 그 목적에 따라 달라지는데, 특정 부위를 확인하는 목적이라면 120-300 bp가 적당하다.

-  ⇤ ← Revision 2 as of 2005-06-22 13:47:57 → 
  Size: 1603
  Editor: 203
  Comment:
+   ← Revision 3 as of 2005-08-11 19:55:42 → ⇥
  Size: 1609
  Editor: 203
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 Line 8:
-T_m = 4(G+C) + 2(A+T)
+$$ T_m = 4(G+C) + 2(A+T) $$