Waters사의 [Proteomics] 솔루션. MassSpectrometry Informatics solution. MassLynx 라는 제품군중 하나.
(참고로 MassLynx의 제품군에는 OpenLynx, QuanLynx, FractionLynx, MetaboLynx, ProteinLynx, NeoLynx, ChromaLynx, MicrobeLynx가 있다.)
http://www.waters.com/watersdivision/waters_website/products/micromass/MS_data.asp#
Integrated tools for [Proteomics]
- Project management
- Relative [Protein] quantification
ProteinIdentification leveraged with the specificity of exact MassSpectrometry data
다양한 MassSpectrometry 및 유사한 기술들에 대한 자동화된 ProteinIdentification을 지원한다.
제품구성
Project management
high throughput protein identification with 2D-PAGE (BioRad and MALDI-TOF-MS
- high specificity protein and peptide analysis with MALDI-MS/MS or ESI-LCn-MS/MS
- protein characterisation - post-translational modification analysis with ESI-LC-MS/MS
- protein quantification - expression analysis by isotope labelling
ClientServer architecture, RelationalDatabase, Automated [Protein], [EST] and genomic databank housekeeping, Secure multiple project, multiple user support, encrypted data transfer and data storage
Data directed analysis
각종 Mass 장비로 부터 데이터 직접 분석
Mass informatics
- PMF - dB searching
- MS/MS fragment ion matching
AutoMod MS/MS fragment ion matching
- Integrated de novo sequencing
- Integrated BLAST
Knowledge sharing
- Sample management and annotation
- Sample Viewing (Gel Viewer and Container Viewer)
- Data processing parameter selection (Data Preparation)
Automated protein identification. Hierarchical data interpretation parameter selection (WorkFlow?Designer)
Single databank searching, AutoMod analysis, de novo sequencing or BLAST.
- MCAT analysis for protein quantification by LC-MS/MS
- Databank management
- New digest reagent tool
- New modification tool (e.g. PTMs and isotope labels)
- Help function
- And others!
그외 각종 정보
최근(2003-02-06) 본 프로그램의 Global SERVER 2.0 suite가 [IBM] eServer pSeries 630에 장착되어 판매된다는 뉴스가 실렸다. 원문기사
ProteinLynx라는 프로그램에 대해 좀 알아보다. 기능들은 일단, 대단한건 없어보이나, [IBM]머신에 장착되어 팔린다니, 이거역시 영업적요소가 마구 작용하는게 아닌가 싶네... 이런종류의 프로그램들... 사용법익히기에도 한참걸릴듯한 대형프로그램~ 프로그램에서 제공하는 틀에 갇히게 될꺼다. 유연하지 못한 연구가 될꺼구... 과연 LifeScience발전에 기여할 수 있을까... 일단, 난 아니라고봄...
방법은,,, 각 연구분야에 specific한 지원... 즉 커스터마이징이 해답이라고 생각되는데... --[yong27], 2003-05-27