Waters사의 [Proteomics] 솔루션. MassSpectrometry Informatics solution. MassLynx 라는 제품군중 하나.

http://www.waters.com/watersdivision/waters_website/products/micromass/MS_data.asp#

Integrated tools for [Proteomics]

다양한 MassSpectrometry 및 유사한 기술들에 대한 자동화된 ProteinIdentification을 지원한다.

제품구성

http://bioinfo.sarang.net/moin/wiki/upload/ProteinLynx.gif

Project management

  • high throughput protein identification with 2D-PAGE (BioRad and MALDI-TOF-MS

  • high specificity protein and peptide analysis with MALDI-MS/MS or ESI-LCn-MS/MS
  • protein characterisation - post-translational modification analysis with ESI-LC-MS/MS
  • protein quantification - expression analysis by isotope labelling

ClientServer architecture, RelationalDatabase, Automated [Protein], [EST] and genomic databank housekeeping, Secure multiple project, multiple user support, encrypted data transfer and data storage

Data directed analysis

각종 Mass 장비로 부터 데이터 직접 분석

Mass informatics

  • PMF - dB searching
  • MS/MS fragment ion matching

  • AutoMod MS/MS fragment ion matching

  • Integrated de novo sequencing
  • Integrated BLAST

Knowledge sharing

  • Sample management and annotation
  • Sample Viewing (Gel Viewer and Container Viewer)
  • Data processing parameter selection (Data Preparation)

  • Automated protein identification. Hierarchical data interpretation parameter selection (WorkFlow?Designer)

  • Single databank searching, AutoMod analysis, de novo sequencing or BLAST.

  • MCAT analysis for protein quantification by LC-MS/MS
  • Databank management
  • New digest reagent tool
  • New modification tool (e.g. PTMs and isotope labels)
  • Help function
  • And others!

그외 각종 정보

최근(2003-02-06) 본 프로그램의 Global SERVER 2.0 suite가 [IBM] eServer pSeries 630에 장착되어 판매된다는 뉴스가 실렸다. 원문기사

ProteinLynx라는 프로그램에 대해 좀 알아보다. 기능들은 일단, 대단한건 없어보이나, [IBM]머신에 장착되어 팔린다니, 이거역시 영업적요소가 마구 작용하는게 아닌가 싶네... 이런종류의 프로그램들... 사용법익히기에도 한참걸릴듯한 대형프로그램~ 프로그램에서 제공하는 틀에 갇히게 될꺼다. 유연하지 못한 연구가 될꺼구... 과연 LifeScience발전에 기여할 수 있을까... 일단, 난 아니라고봄...

방법은,,, 각 연구분야에 specific한 지원... 즉 커스터마이징이 해답이라고 생각되는데... --[yong27], 2003-05-27

CategoryProgramBio

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