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ShortTandemRepeat Short_tandem_repeat = [Microsatellite]

DNA Profiling 에 사용될 수 있는 VNTR의 한가지로 대표적인 GeneticVariation의 하나이다. 길이는 2~10반복이다.

다음과 같은 이유들로 QTL탐색 및 유전자지도작성을 위한 GeneticMarker로 각광받고 있다.

Gene의 전반에 걸쳐 많이 나타난다.
고도의 다형성을 가진다.
유전자에 무작위로 분포한다.
공우성(co-dominance) 유전양식을 따른다.
해당 Locus의 서열분석작업 자동화가 쉽다.

현재 HumanGenome에서 3000여개 이상의 MicroSatellite marker가 분리 및 등록되었다. 그 Gene의 Locus는 STS로 결정하여 YAC의 인접지도등의 물리 지도 작성에 이용한다. 모든 MicroSatellite marker의 정보는 GDB등에서 얻을 수 있다.

미국 CODIS 에서 개인식별에 사용하는 13개의 STR은 다음과 같다.

D3S1358
THO1
D21s11
D18s51
D5s818
D13s317
D7s820
D16s539
CSF1PO
vWA
D8S1179
TPOX
FGA

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  Comment:
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 Line 1:
-ShortTendomRepeat
+ShortTandemRepeat WikiPedia:Short_tandem_repeat = [Microsatellite]

DNA Profiling 에 사용될 수 있는 [[VNTR]]의 한가지로 대표적인 GeneticVariation의 하나이다. 길이는 2~10반복이다. 

다음과 같은 이유들로 [[QTL]]탐색 및 유전자지도작성을 위한 GeneticMarker로 각광받고 있다.
 * [[Gene]]의 전반에 걸쳐 많이 나타난다.
 * 고도의 다형성을 가진다.
 * 유전자에 무작위로 분포한다.
 * 공우성(co-dominance) 유전양식을 따른다.
 * 해당 [[Locus]]의 서열분석작업 자동화가 쉽다.

현재 HumanGenome에서 3000여개 이상의 MicroSatellite marker가 분리 및 등록되었다. 그 [[Gene]]의 [[Locus]]는 [[STS]]로 결정하여 [[YAC]]의 인접지도등의 물리 지도 작성에 이용한다. 모든 MicroSatellite marker의 정보는 [[GDB]]등에서 얻을 수 있다.

미국 WikiPedia:CODIS 에서 개인식별에 사용하는 13개의 STR은 다음과 같다.

    * D3S1358
    * THO1
    * D21s11
    * D18s51
    * D5s818
    * D13s317
    * D7s820
    * D16s539
    * CSF1PO
    * vWA
    * D8S1179
    * TPOX
    * FGA


관련프로그램
 * ExcelMicrosatelliteToolkit