2006-10-16

• [http://www.biologynews.net/archives/2006/10/13/new_research_to_cut_animal_testing.html new research to cut animal testing] -- Biology News Net

  • : 새로운 신약을 개발할때 그 약이 치료효과가 탁월하더라도 정상인에게서 안전성이 입증되어야만 허가를 받을 수 있다. 그러나, 인간에게 실험을 할 수 없기 때문에 임상시험에 들어가기 전에 동물실험을 통해서 간접적으로 문제가 있는지 확인을 하는데, 이러한 복잡한 과정때문에 신약의 개발비나 기간이 늘어나게 된다. 본 내용에서는 인간의 간세포에서 독성 test를 수행하므로써, 동물실험에 들어가는 비용이나 시간을 절약할 수가 있다는 내용이다.

2006-10-14

• [http://silverain.dankun.net/tt/index.php?pl=250 서울시내 실시간 CCTV정보]

2006-10-12

• 지난 달(꼭 한달이 되었다.)부터 학위논문에 관한 테마를 잡고 나서, 마지막으로 Candidate Data를 systemic한 관점에서 실험적으로 증명하고자 어떤 단백질의 리스트들을 가지고, 여러 informational database의 정보를 조사해서 서로 연관성(interaction)이 있는 것들을 연결한 protein network graph를 그려보기로 계획을 세웠다. 처음에 한 논문에서 [http://www.ingenuity.com/ Ingenuity Pathway Analysis(IPA)]라는 Web Tool을 알게 되었고, 이것이 상용프로그램이라서 이용을 포기한 후 [http://sbi.imim.es/piana/ PIANA]라는 program을 발견하여 이용하려 했으나, 시간의 부족과 이해의 부족 때문에 [http://biologicalnetworks.net/ BiologicalNetworks]라는 자바로 개발되었고, 웹상에서 그냥 다운받으면 DataBase를 설치할 필요도 없이 이용하기만 하면 되며 설명을 보니 내가 생각하는 기능을 모두 갖추고 있는 것으로 생각되어 이용하려 했으나, 자바 Web start의 오류에서 부터 간신히 설치하고 난 후에도 Tutorial에 나와 있는 설명으로는 내가 생각하는 일들을 할 수 없었고(내가 잘 모르고 있기 때문일 수도 있다.), 웹 site 어디에도 자세한 설명이 되어있지 않았다. 보통 tutorial은 원하는 일을 순차적으로 진행하는 과정을 설명한 것이라 생각되는데, 이해가 잘 되지않았다. 결국 오늘 드디어 이 프로그램을 사용하지 않기로 결정했다. Web상에서 다운받기만 하면되는 것이 좋을수도 있지만, 그 기능을 쓰기가 어렵고, 어떻게 작동되는지 이해되지 않는 것은 오히려 사용하기에 불편할 수도 있다는 생각이 들었다. 한마디로 이곳저곳 찔러만 보고 원하는 것은 이루지 못했당. T T

2006-10-11

• [http://www.biologynews.net/archives/2006/10/09/first_major_study_of_mammalian_disorderly_proteins.html first major study of mammalian disorderly proteins] -- Biology News Net

{{|Unlike the classic description of proteins described in science textbooks, IUPs are not completely locked into rigid, 3-D shapes that determine their function in the cell. Instead, IUPs have varying amounts of flexibility within their sometimes spaghetti-like structures that is critical for function. |}}

• : intrinsically unstructured proteins (IUPs)는 다른 단백질과는 달리 그 형태가 정해져 있지 않고, 구조가 자주 바뀌는 특징을 가지고 있는데, IUPs가 여러 Cell function에 관여한다는 사실이 밝혀지고 있으며, 이러한 중요성을 인식한 St. Jude Children's Research Hospital에서 Cell내에 존재하는 IUPs들을 조사해 본 결과 다른 단백질처럼 일관된 구조를 이루고 있는 것이 아니라 특정 molecule과의 상호작용에 따라 그 구조가 매우 flexible하게 변하기 때문에, 이들의 구조가 변화하는 것이 중요한게 아니라 어떤 형태에서 어떤 작용을 하는지가 더 중요하다는 사실을 알아냈다.

• [http://www.biologynews.net/archives/2006/10/10/powerful_genome_id_method_extended_to_humans.html powerful genome id method extended to humans] -- Biology News Net

{{|The power of optical mapping lies in its ability to reveal the size and large-scale structure of a genome. The method uses fluorescence microscopy to image individual DNA molecules that have been divided into orderly fragments by so-called restriction enzymes. |}}

• : 보통 [Chromosome]의 염기서열을 확인하는 방법을 [DNA] [Sequencing]이라 하는데, 전체적인 염기서열을 모두 확인하는 것이 어렵기도 하며 [DNA] [Sequencing] 방법의 오류도 있어서 100% 완전한 염기서열을 해독하는 것은 힘들고 시간이 오래걸린다. 본 내용에서는 현광현미경을 이용해서 개개의 DNA molecule의 image를 분석하는 Optical mapping이란 방법을 개발하였는데, 이것을 통해서 빠르고 효과적으로 개개인의 chromosome DNA Sequecing을 할 수 있게 되었다고 한다.

2006-10-10

• [GParted]를 이용해서 리눅스의 /var size를 늘리느라 하루를 다 소비했다.

  [AnswerMe] : 물리적으로 분리되어있는 partition(ex. /dev/sda1와 /dev/sda2)을 한가지 directory로 설정해 줄 수 있나요?

2006-10-04

• [http://medialab.egloos.com/1424423 Connotea] -- Meida Lab's Blog

  • : 논문 reference를 저장하는 EndNote와 같은 Tool.

2006-10-02

• 오늘부터 음악(서버에 사운드카드가 없기때문에)과 인터넷뱅킹을 제외한 모든 일들을 리눅스체제(UbuntuLinux)에서 하기로 결정!!!(정말이야? 자신있어? 음.. 글쎄.)

• 이번주는 대략 노는 분위기 일듯...

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