[Genome]서열정보 주석달기.

어떤방법들을 통하여 [Genome]정보를 해석할 수 있을까.

보통은, GenePrediction --> [BLAST], [HMMER]

관련정보

• GeneAnnotation.pdf

• [PEDANT]

종에 따른 해석방법

Prokaryotic

[TIGR]에 보면 미생물 GenomeAnnotation에 관한 체계적인 프로세스가 나와있다.

Euckaryotic

• GenePrediction using GenScan, [Orpheus]

• [BLAST]n in [dbEST] for coding region and RnaSplicing confirmation

• t[RNA], r[RNA] confirmation using [tRNAscan-SE]

• Repeat sequence confirmation using RepeatMasker

• PromoterPrediction

• regulatory region (TranscriptionFactor) confirmation using [TESS]

• CpgIsland 탐색 using CpgPlot

• MembraneProtein 탐색

• ProteinStructure가 알려진 단백질에 대한 주석