FragmentAssembly viewer 프로그램

http://www.phrap.org/consed/consed.html

Linux에서 X11을 이용한 GUI프로그램이다. Phrap의 ACE 파일을 읽어서 FragmentAssembly현황을 보여준다. 최근에는 PolyPhred에서 만들어진 SNP예측현황도 확인 할 수 있다.

각 contig별 서열 trace를 볼 수 있다. Phred점수가 낮은부분은 소문자로 표시. 또한 scafold 정보도 그래픽적으로 확인할 수 있다.

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Consed (last edited 2013-07-29 10:46:26 by 61)

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