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ProteinStructure 관련 [[Database]] * [[PDB]] * [[SCOP]] * [[CATH]] * [[FSSP]] |
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| [CASP]이라는 ProteinStructure Prediction 경진대회가 있다. 이것은 실제 풀기 어려운문제이다. SeeAlso LevintalParadox | [[CASP]]이라는 ProteinStructure Prediction 경진대회가 있다. 이것은 실제 풀기 어려운문제이다. SeeAlso LevintalParadox |
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| 구조가 알려진 단백질에서, AminoAcid하나를 변경했을때 구조가 많이 바뀌는가, 안바뀌는가 알수있는 프로그램 내지는 [Algorithm]이 있던가요? AnswerMe... --[yong27], 2004-08-30 | 구조가 알려진 단백질에서, AminoAcid하나를 변경했을때 구조가 많이 바뀌는가, 안바뀌는가 알수있는 프로그램 내지는 [[Algorithm]]이 있던가요? AnswerMe... --[[yong27]], 2004-08-30 |
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| 요 윗 질문의 해결방법이 있다면, 그것을 이용해서, 전체 서열의 구조를 예측하는 것이 가능할 것이다. A라는 구조가 알려진 단백질에서 시작해서, 아미노산 하나씩 하나씩 바꿔나가면 되지 않을까. 연구관련 NewIdea --[yong27], 2004-11-06 | 요 윗 질문의 해결방법이 있다면, 그것을 이용해서, 전체 서열의 구조를 예측하는 것이 가능할 것이다. A라는 구조가 알려진 단백질에서 시작해서, 아미노산 하나씩 하나씩 바꿔나가면 되지 않을까. 연구관련 NewIdea --[[yong27]], 2004-11-06 |
단백질의 구조. One of the BiomoleculeStructureAnalysis
Protein의 4가지 structure는 '분류'라기보다는 일련의 전개과정이라 생각할 수 있다.
- primary structure(amino acid sequence) 에서
- secondary structure(α helix, β-sheet and β-turn)가 생기고, 이런 기본적인 motif들이
- tertiary structure를 형성하게 됩니다.
quatary structure는 tertiray structure(subunit) 2개 이상이 결합(by NonCovalentBond)하여 생기는 protein을 말한다.
AminoAcid간에 크게 두가지 각도가 존재한다. 이 두 각도를 통해 RamachandranPlot을 그려보면 2차구조의 패턴을 알 수 있다.
하나의 폴리펩타이드 사슬중에서도 뭉치를 이루는 특정영역을 Domain이라고 한다. 서열이 많이 다른데 구조가 비슷한 것을 RemoteHomology하다고 한다.
ProteinStructure 관련 Database
관련 프로그램
관련자료
구조비교도구
- NCBI VAST
- DALI
- CE
- TM-align
- Multiplot
CASP이라는 ProteinStructure Prediction 경진대회가 있다. 이것은 실제 풀기 어려운문제이다. SeeAlso LevintalParadox
구조가 알려진 단백질에서, AminoAcid하나를 변경했을때 구조가 많이 바뀌는가, 안바뀌는가 알수있는 프로그램 내지는 Algorithm이 있던가요? AnswerMe... --yong27, 2004-08-30
요 윗 질문의 해결방법이 있다면, 그것을 이용해서, 전체 서열의 구조를 예측하는 것이 가능할 것이다. A라는 구조가 알려진 단백질에서 시작해서, 아미노산 하나씩 하나씩 바꿔나가면 되지 않을까. 연구관련 NewIdea --yong27, 2004-11-06
Related Links Carlson Lab