PeptideMassFingerprint에 사용되는 Algorithm

SequenceAlignment와 유사한 DynamicProgramming방법이 사용된다. MassSpectrometry에서 출력되는 스펙트럼을 Protein Database내의 서열에 대해 가상의 스펙트럼을 만들고 이와 매치하는 방법

매치후에 점수를 매겨서 순위를 나타내야 하는데 다음의 방법들이 사용된다.

• number of matches approaches : peptide의 매치가 가장 많은 것에 점수를 가장 많이 주는 방법

• MOWSE : 주어진 분자량 범위내의 모든 Protein들에 대해 peptide들의 observed frequency를 이용

• ProFound : BayesianInference이용