Size: 1152
Comment:
|
← Revision 8 as of 2013-08-12 13:50:56 ⇥
Size: 1272
Comment:
|
Deletions are marked like this. | Additions are marked like this. |
Line 5: | Line 5: |
보통은, GenePrediction --> [[BLAST]], [[HMMER]] | 보통은, GenePrediction --> [[BLAST]], [[HMMER]]의 방법을 기대할 수 있다. 유전체내 유전자의 구조를 밝히는 것을 GeneModeling 이라고 한다. |
Genome서열정보 주석달기.
어떤방법들을 통하여 Genome정보를 해석할 수 있을까.
보통은, GenePrediction --> BLAST, HMMER의 방법을 기대할 수 있다. 유전체내 유전자의 구조를 밝히는 것을 GeneModeling 이라고 한다.
관련정보
종에 따른 해석방법
Prokaryotic
TIGR에 보면 미생물 GenomeAnnotation에 관한 체계적인 프로세스가 나와있다.
Euckaryotic
논문
A beginner's guide to eukaryotic genome annotation (Nature reviews, May 2012)
관련프로그램
관련방법들
GenePrediction using GenScan, Orpheus, Augustus, SNAP, TwinScan, FGENESH
tRNA, rRNA confirmation using tRNAscan-SE
Repeat sequence confirmation using RepeatMasker
Gene structure determination with EST, Protein, RNA-seq matching
regulatory region (TranscriptionFactor) confirmation using TESS
CpG_island 탐색 using CpgPlot
ProteinStructure가 알려진 단백질에 대한 주석