BiologicalSequenceAnalysis에서 사용하는 SequenceAlignment에는

비교대상 서열의 가짓수에 따라

• PairwiseAlignment

• MultipleAlignment

서열내에서 전역으로 정렬하느냐, 부분적으로 정렬하느냐에 따라

• GlobalAlignment

• LocalAlignment

속도개선

• LinearSpaceAlignment

For PeptideMassFingerprint in [Proteomics]

• SpectralAlignment

관련된 알고리즘들

• NeedlemanWunschAlgorithm : GlobalAlignment

• SmithWatermanAlgorithm : LocalAlignment

• GotohAlgorithm :

• MyersMillerAlgorithm